1892年宽仁医院建立后不久，医院即开展外伤救治。上世纪20年代开始对骨折进行治疗，建立了骨科技术的雏形。50年代初，马佐民医师到天津医院，师从骨科前辈方先之教授学习骨科技术后，建立了骨科病房，成为骨科前身，开展手术治疗骨科伤病。如脊柱结核病灶清除术，马蹄内翻足矫正术，股骨颈骨折三翼钉固定术等骨科手术。1973年上海医学院支援建立重庆医学院的专家陈秉礼医师组建了重庆医学院附二院骨科。现为重庆市集医教研为一体的重点学科。博士学位授予点。科室目前现有医生12人，其中博士生导师1人，硕士生导师4人，博士5人，留学回国人员3人。重庆市骨科学学科带头人1名。